Son birkaç gündür COVID-19 için tespit kitleri medyada bulunuyordu. Hükümetin 50.000'den fazla düşük güvenilirlik testi satın alması ve bunun sonucunda ortaya çıkan kayıplar nedeniyle ortaya çıkan tartışmalardan sonra, enfekte hastaların tespit yöntemlerini anlama konusundaki düşünceleri zorunlu hale gelmiştir. PCR nedir?

Hepimiz bunu duyacağız: "PCR yöntemi en eksiksiz ve güvenilirdir". Yüksek vuruş oranları ve minimum yanlış pozitifleri, Dünya Sağlık Örgütü'nü (WHO) ana tespit yöntemi olarak tavsiye etmelerini sağladı.

Çeşitli virüsler bu virüsün tespit yöntemlerini kapsıyor, ancak bu sefer size bir PCR'nin ne olduğunu ve nasıl çalıştığını ayrıntılı olarak gösterme fırsatını sunmak istiyoruz. Okumaya devam edin ve hakkında daha fazla bilgi edinin!

Düşmanı sıralama

Koronavirüs (COVID-19), tek bir RNA ipliği içeren viral bir ajandır. Buna karşılık, pozitif tek sarmallı RNA olarak sınıflandırılır. DNA ve RNA, bir organizmanın gösterebileceği en güvenilir 'parmak izleridir'.

Onu oluşturan nükleotitlerin sırası, bireyin kimliğini ortaya çıkarır ve türler ve organizmalar için birçok ortak bölge vardır. Tek bir bilgi zincirinden oluşan, vücutta koronavirüs RNA'nın varlığı açıktır: hastanın örneğinde mevcutsa, enfekte olmasıdır.

Gözleyebileceğiniz bu harflerin birleşimi, virüsün RNA zincirinin nükleotitlerinin sırasına karşılık gelir. Her nükleotid, temsil edilen harfe karşılık gelen azotlu bir baz içerir:

• Adenin (A)
• Guanine (g)
• Sitosin (c)
• RNA durumunda, urasil (u)
• DNA durumunda timin (t)

O zaman size koronavirüs genomunda tek bir tane (u) görmemeniz gerekir , değil mi? bu açıklamada bizimle devam edin, çünkü bir cevabı var.

PCR davetsiz misafirleri tespit eder

Virüs sıralandıktan sonra, PCR'nin etkinliği devreye girer. 80'li ve Polimeraz Zincir Reaksiyonu adıyla karşılık gelen bu teknik, bir numunenin DNA'sını yükseltmeyi amaçlamaktadır.

Evet, burası ilk virüs tuzağının yattığı yerdir: koronavirüsün RNA olmasa DNA'sı yoktur, bu yüzden daha da karmaşık bir teknik gereklidir: RT-PCR, virüsün RNA'sını DNA'ya dönüştürmek için.

Bu reaksiyonu gerçekleştirmek için ters transkriptaz adı verilen bir enzim önemlidir. İşlem aşağıdaki gibidir:

• Hastanın örneğinden, enzim ters transkriptaz virüsün RNA'sını "tanımlayabilir".
• Reaksiyon karışımında sağlanan nükleotitler ile transkriptaz enzimi, virüsün RNA'sını tamamlayıcı bir DNA zinciri üretebilecektir. Bu enzimi bir işçi olarak görmeliyiz: virüsün RNA'sının haritası ve mevcut nükleotitler ile yeni bir zincir, bu durumda DNA üretir.
• Burada polimeraz enzimi devreye girer ve normal bir PCR oluşur. Kısacası, enzim polimeraz, mevcut nükleotidlerle, dönüştürülmüş DNA dizisinin binlerce kopyasını üretebilen başka bir işçidir.
• Bu amplifiye DNA, koronavirüs genotipine karşılık gelip gelmediğini belirlemek için farklı tekniklere tabi tutulabilir.

PCR, Dünya Sağlık Örgütü (WHO) tarafından en çok tavsiye edilen COVID-19 için tespit yöntemidir.

Kimliği ortaya çıkarmak

DNA amplifiye edildiğinde, bir virüse veya organizmaya atamak için birçok teknik vardır. En basitlerinden biri agaroz jel elektroforezidir. Bu örneği basitlik için kullanacağız, ancak bunu yapan karmaşık sıralayıcılar var.

DNA fragmanları negatif elektrik yüküne sahiptir. Bu sayede ve agaroz jel kutusuna bir elektrik akımı uygulayarak, farklı fragmanlar, pozitif kutbun çektiği süre boyunca jel boyunca hareket edecektir. Bunu bir yarış olarak görmeliyiz: en hafif DNA parçaları daha erken gelir ve en büyük parçalar yarıda kalır.

Algılamanın anahtarı budur: bantlar jel üzerinde farklı mesafelerde oluşur. Varsayımsal bir örnek alındığında, eğer bir anne ve bir çocuğun aynı olan farklı kesin DNA fragmanları varsa, ikisinin agaroz jelleri genetik ilişkilerini doğrulayan aynı modeli göstermelidir.

Koronavirüs saptama yöntemlerinin gösterilen örnekten daha karmaşık olduğu açıktır , ancak bu açıklama ile bir PCR'nin çalışmasının ve hastalıkların saptanmasındaki temel rolünün net olacağını umuyoruz.